Viņš ir kamerorķestra Sinfonietta Rīga un Latvijas Nacionālās operas un baleta orķestra obojists, paralēli attīstot diriģenta karjeru. Studē diriģēšanu Jāzepa Vītola Latvijas Mūzikas akadēmijā un savu meistarību pilnveidojis pasaulslavenā diriģenta Pāvo Jervi meistarklasēs.
Māris Kuģis regulāri uzstājas kā solists un kamermūziķis, piedalās laikmetīgās mūzikas pirmatskaņojumos un ir iesaistīts jauno komponistu izglītošanā. Kā diriģents viņš sadarbojies ar Orķestri Rīga, Latvijas Nacionālo simfonisko orķestri un stīgu orķestri B-Sharp, veidojot daudzveidīgas koncertprogrammas, kas aptver gan klasisko repertuāru, gan mūsdienu mūziku. Viņa muzikālo darbību raksturo augsta profesionalitāte, stilistiska daudzpusība un dziļa interese par simfoniskās mūzikas interpretāciju.
