Kopš 2000. gada viņš ir Drēzdenes Zempera operas trupas solists, kur atveidojis daudzas nozīmīgas Vāgnera, Verdi, Štrausa un Mocarta operu lomas, tostarp Votānu, Klīstošo holandieti, Rigoleto, Johanānu, Skarpiju un Jago. Markuss Markvarts uzstājies arī pasaules ievērojamākajos operteātros, tostarp Vīnes Valsts operā, Milānas Teatro alla Scala, Parīzes Nacionālajā operā, Kanādas Operā un Nīderlandes Nacionālajā operā. Līdztekus operkarjerai viņš ir augstu novērtēts koncertdziedātājs, sadarbojoties ar tādiem izciliem diriģentiem kā Saimons Retls, Kristiāns Tīlemanis, Vladimirs Jurovskis un Fabio Luizi.
